1.结合财政困难程度进行分配根据《办法》，专项资金按照各地区年度城镇低收入住房保障家庭租赁补贴户数、筹集公共租赁住房套数、城市棚户区改造户数等三项因素以及相应权重，结合财政困难程度进行分配 。

2.从具体使用范围看，整合后的专项资金主要用于向符合条件的在市场租赁住房的城镇低收入住房保障家庭发放租赁补贴，支持政府组织实施的公共租赁住房项目，以及支持城市棚户区 改造项目。在棚改项目方面，专项资金用于支持棚户区改造项目的征收、安置房建设和相关配套基础设施建设以及贷款贴息等支出，但不得用于城市棚户区改造中回迁安置之外的住房开发 、配套建设的商业和服务业等经营性设施建设支出。

3.财税专家施正文向《每日经济新闻》记者表示，专项转移支付资金合并也是改革的一个方向，城镇保障性安居工程的三项资金整合一定程度上形成了规模效益。